6 附录
6.1.1常用抗生素配方
6.1.2常用母液配方
6.1.3缓冲液(pH 6-10)的pKa及缓冲范围
6.1.4磷酸缓冲液配方
6.2.1常用网站
6.2.2通用测序引物
6.2.3密码子及其偏好性表格
6.2.4空间群表格
6.2.5线站新衍射仪BL17U1
6.2.6实验室载体
6.2.7实验室细胞株及菌株
6.2.8结晶试剂盒
抗生素 | 母液浓度（mg/mL） | 工作浓度（μg/mL）for 严紧型质粒 | 工作浓度（μg/mL）for 松驰型质粒 | 处理方式 | |
Ampicillin，氨苄青霉素(Amp) | 100（溶于水） | 20 | 60 | 过滤除菌 | |
Kanamycin，卡那霉素(Kan) | 50 （溶于水） | 10 | 50 | 过滤除菌／高压 | |
Chloramphenicol，氯霉素(Chl/Cm/CAP) | 34 （溶于乙醇）
| 25 | 170 | 无需灭菌 | |
Carbenicillin，羧苄青霉素(Cab) | 50 （溶于水） | 20 | 60 | 过滤除菌 | |
Streptomycin，链霉素(Sm) | 10 （溶于水） | 10 | 50 | 过滤除菌 | |
Tetracyyline，四环素(Tet) | 5 （溶于甲醇） | 10 | 50 | 无需灭菌 | |
1. 保存条件：建议 -20 °C保存。
2. mycin，霉素，在不严格的缩写中作为“XX霉素”的后缀缩写为m。
3. 氯霉素（Chlor Am Phenicol），氯氨苯醇，标准缩写CAP，有时也写做Cm。
4. 过滤灭菌：用0.22 μm一次性滤膜过滤除菌，于超净台内。
5. 母液配制方法举例，如100 mg/mL氨苄青霉素：溶解1 g氨苄青霉素钠盐于足量的水中，最后定容至10 mL。分装成小份于-20 °C贮存。常以25 μg/mL～50 μg/mL的终浓度添加于生长培养基
1. 50× TAE（1 L）：
Tris 242 g
Glacial Acetic Acid (冰醋酸) 57.1 mL
0.5 M EDTA 100 mL
2. 10× TBE（1 L）：
Tris 108.8 g
Boric Acid 55.0 g
0.5 M EDTA 40 mL
3. 6×DNA Loading Buffer（100 mL）：
1 M Tris-HCl pH 7.4 10 mL
100% Glycerol 60 mL
0.5 M EDTA 12 mL
Bromophenol Blue 0.01 g
4. 0.5 M EDTA pH 8.0（500 mL）：
EDTA Disodium Salt Dihydrate 93.05 g
Dissolve with about 700 mL ddH2O, stir, then adjust pH to 8.0 (1 M NaOH)
Adjust the volume to 1 L. Filtered with 0.22 μm membrane or autoclave.
**EDTA does not dissolve until nearly pH 8.0
5. X-Gal （40 mg/mL）, 1000×（5 mL）
X-Gal 0.200 g
Dimethyl Foramide 5 mL
（use glass pipette!）
Make ~500 μL aliquots. Store in brown glass vials at -20 °C.
6. SOC medium（250 mL）
Tryptone Peptone 5 g
Yeast extract 1.25 g
NaCl 0.15 g
KCl（10 mM） 0.05 g
MgCl2（10 mM） 0.51 g
50% glucose 4 mL
add sterile and MgCl2 and glucose after autoclaving
7. Solutions for Plasmid Preparations
1) Qiagen Buffer P1：50 mM Tris-HCl pH 8.0，10 mM EDTA，100 μg/mL RNaseA
&：for resuspension of cells in DNA plasmid preparation. 和生工P1通用。
1 M Tris pH 8.0 5 mL
0.5 M EDTA pH 8.0 2 mL
add ddH2O to 100 mL, Autoclave. Rnase A (add after autoclaving) 10.0 mg. Store at 4 °C
2) Qiagen Buffer P2：200 mM NaOH，1% SDS
&：for lysis of cells in DNA plasmid preparation. 和生工P2通用。
NaOH 0.8 g
SDS 1.0 g
add ddH2O to 100 mL
3) Qiagen Buffer P3：3.0 M potassium acetate pH 5.5,
&：not for spin columns, but for Qiatips, midi, maxi, giga kits
Potassium Acetate 25.03 g
Acetic Acid, Galacial ~11.5 mL
Adjust pH to 5.5, add ddH2O to 100 mL
4) Qiagen Buffer N3：4.2 M Gu-HCl，0.9 M potassium acetate pH 4.8
&：as nutrealization buffer to precipitate proteins and genomic materials，和生工小抽试剂盒P3通用。
5) Qiagen Buffer PB（5 M Gu-HCl, 30% isopropanol）＝PBI（I for pH indicator）
6) Qiagen Buffer QG（5.5 M guanidine thiocyanate （GuSCN），20 mM Tris HCl pH 6.6）
7) Qiagen Buffer PE（10 mM Tris-HCl pH 7.5，80% ethanol ）
&：for spin column salt wash in miniprep （blue）or pink columns. 用于质粒小抽和核酸提取离心柱清洗除盐。
8) Qiagen Buffer QX1：7 M NaPO4，10 mM NaAc pH 5.3
&：for solution and binding of agarose gels，用在用琼脂糖珠子DNA纯化试剂盒。
9) Qiagen Buffer QXB：5 M GuHCl
&：for binding of large >3000 bp fragments to columns
10) Qiagen Buffer QBT：750 mM NaCl，50 mM MOPS pH 7.0，15% isopropanol，0.15% triton X-100
&：Equilibration buffer
NaCl 4.38 g
Isopropanol 15 mL
MOPS 1.05 g
Triton X-100 150 mL
Adjust pH to 7.0（use 1N）, add ddH2O to 100 mL
11) Qiagen Buffer QC：1.0 M NaCl，50 mM MOPS pH 7.0，15% isopropanol
&：Wash buffer
NaCl 5.84 g
MOPS 1.05 g
Isopropanol 15 mL
Adjust pH to 7.0, add ddH2O to 100 mL ,filter sterilize.
12) Qiagen Buffer QF：1.25 M NaCl， 50 mM Tris-HCl pH 8.5，15% isopropanol
&：Elution buffer
NaCl 7.31 g
Tris 8.5 1 M 5 mL
Isopropanol 15 mL
Adjust pH to 8.5, add ddH2O to 100 mL
8. Buffers for Protein Electrophoresis
1) 6×SDS Sample Buffer
1 M Tris-HCl pH 6.8 25 mL
10% SDS 20 mL
50% Glycerol 50 mL
1 M DTT 2 mL
Bromophenol Blue 0.01 g
Add ddH2O to 100 mL
2) Coommassie Blue Staining Solution（500 mL）：
Coommassie Brilliant Blue R250 0.5 g
Ethanol 200 mL
Acetic acid: 50 mL
ddH2O to 500 mL（~250 mL）
（Dissolve Coommassie in Ethanol before adding water and acetic acid will require stirring 1~2 hours）
3) Coommassie Blue Destaining Solution （500 mL）：
Ethanol 200 mL
Acetic Acid 50 mL
ddH2O 250 mL
4) 20×MES-SDS running buffer （1 L）：MES：2-(N-吗啉)乙磺酸一水合物
&：For high-resolution separation of small size proteins.
MES 195.2 g
Tris 121.2 g
SDS 20 g
EDTA 6 g
9. Molecular Biology Buffers:
1) A1：1×NEBuffer 1（yellow）：10 mM Bis Tris Propane-HCl，10 mM MgCl2，1 mM DTT pH 7.0 @ 25 °C。Supplied as a 10×concentrated stock.
2) A2：1×NEBuffer 2（blue）：50 mM NaCl, 10 mM Tris-HCl，10 mM MgCl2，1 mM DTT pH 7.9 @ 25 °C。Supplied as a 10×concentrated stock.
3) A2：1×NEBuffer 3（red）：100 mM NaCl, 50 mM Tris-HCl，10 mM MgCl2，1 mM DTT pH 7.9 @ 25 °C。Supplied as a 10×concentrated stock.
4) A2：1×NEBuffer 4（green，cutsmart buffer）：50 mM potassium acetate，20 mM Tris acetate，10 mM magnesium acetate，1 mM DTT, pH 7.9 @ 25 °C。Supplied as a 10×concentrated stock.
5) 2×T4 DNA quick ligase 快连接酶buffer：60 mM Tris-HCl pH 7.8，20 mM MgCl2，2 mM DTT，2 mM ATP and 10% PEG6000
6) 10×T4 DNA连接酶buffer：500 mM Tris-HCl pH 7.6，100 mM MgCl2，100 mM DTT，10 mM ATP
7) 10×pfu buffer：200 mM Tris-HCl pH 8.6，100 mM KCl，160 mM (NH4)2SO4，10 mM MgCl2，1% Triton X-100，1 mg/mL BSA。
8) 5×HF buffer：32 mM HEPES-KOH buffer pH 7.8，100 mM KAcO, 4 mM Mg (AcO) 2，0.05% BSA（0.5 mg/mL）
9) 5×GC rich buffer：32 mM HEPES-KOH buffer pH 7.8，100 mM KAcO，7.5 mM Mg(AcO)2，0.01% BSA（0.1 mg/mL），1.0% DMSO
10) 2×Taq mix:
1 M Tris-HCl pH 8.6 4 mL
1 M KCl 20 mL
1 M MgCl2 600 μL
Sucrose 68 g
dNTP （2 mM each） 40 mL
1% Cresol Red（甲酚红） 2 mL
Taq polymerase （2U/μL） 20 mL
Add ddH2O to 200 mL
11) 10×Taq buffer:
200 mM Tris-HCl 8.4，200 mM KC，100 mM (NH4)2SO4，30 mM MgSO4，1 mg/mL BSA
6.1.3 缓冲液(pH 6-10)的pKa及缓冲范围
缓冲液 | pKa（25°C） | 缓冲范围 | 分子量 | 中文全称 |
MES | 6.1 | 5.5~6.7 | 195.2 | 2-吗啉乙磺酸 |
Bis-Tris | 6.5 | 5.8~7.2 | 209.2 | 二(2-羟乙基)亚胺基三(羟甲基)甲烷 |
ADA | 6.6 | 6.0~7.2 | 190.2 | N-(氨基甲酰基甲基)亚氨基二乙酸 |
ACES | 6.8 | 6.1~7.5 | 182.2 | N-氨基甲酰甲基乙磺酸 |
PIPES | 6.8 | 6.1~7.5 | 302.4 | 哌嗪-N，N'-二(2-乙磺酸) |
MOPSO | 6.9 | 6.2~7.6 | 225.3 | 3-(N-吗啉基)-2-羟基丙磺酸 |
Bis-Tris Propane | 6.8 | 6.3~9.5 | 282.3 | 双[三(羟甲基)氨基丙烷]/1,3-二[三(羟甲基)甲氨基]丙烷 |
BES | 7.1 | 6.4~7.8 | 213.2 | N-双(2-羟乙基)-2-氨基乙璜酸 |
MOPS | 7.2 | 6.5~7.9 | 209.3 | 3-(N-吗啡啉)乙磺酸 |
HEPES | 7.5 | 6.8~8.2 | 238.3 | N-2-羟乙基哌嗪-N'-2-乙磺酸 |
TES | 7.4 | 6.8~8.2 | 229.2 | N-3-(羟甲基)甲基-2-氨基乙磺酸 |
DIPSO | 7.6 | 7.0~8.2 | 243.3 | 3-[N-N-双(2-羟乙基)氨基]-2-羟基丙磺酸 |
TAPSO | 7.6 | 7.0~8.2 | 259.3 | N-3-(羟甲基)甲氨基-2-羟基丙烷磺酸 |
Tris | 8.1 | 7.0~9.1 | 121.1 | 三羟甲基氨基甲烷 |
HEPPSO | 7.8 | 7.1~8.5 | 268.3 | 4-(2-羟乙基)哌嗪-1-2-羟基丙磺酸 |
POPSO | 7.8 | 7.2~8.5 | 362.4 | 哌嗪-1,4-二羟基丙磺酸 |
EPPS | 8.0 | 7.3~8.7 | 252.3 | 4-羟乙基哌嗪丙磺酸 |
TEA | 7.8 | 7.3~8.3 | 149.2 | 三乙醇胺 |
Tricine | 8.1 | 7.4~8.8 | 179.2 | N-三-(羟甲基)甲基氨基乙酸 |
Bicine | 8.3 | 7.6~9.0 | 163.2 | N,N-双(2-羟乙基)甘氨酸 |
TAPS | 8.4 | 7.7~9.1 | 243.3 | 三羟甲基甲胺基丙磺酸 |
AMPSO | 9.0 | 8.3~9.7 | 227.3 | 3-[N-(1，1-二甲基-2-羟乙基)]氨基-2-羟丙烷磺酸 |
CHES | 9.3 | 8.6~10.0 | 207.3 | 2-(环已胺)-1-乙磺酸 |
CAPSO | 9.6 | 8.9~10.3 | 237.3 | 3-(环已胺)-2-羟基-1-丙磺酸 |
AMP | 9.7 | 9.0~10.5 | 89.1 | 2-氨基-2-甲基-1-丙醇 |
CAPS | 10.4 | 9.7~11.1 | 221.3 | 3-(环已胺)-1-丙磺酸 |
材料（MATERIALS）
r 试剂（REAGENTS）
NaH2PO4·2H2O、Na2HPO4·12H2O
配制方法：
配制时，常先配制0.2 M的NaH2PO4和0.2 M的Na2HPO4，两者按一定比例混合即成0.2 M的磷酸盐缓冲液（PB），根据需要可配制不同浓度的PB和PBS。
1. 0.2 M的 NaH2PO4：称取NaH2PO4.2H2O 31.21 g（或 NaH2PO4·H2O 27.6 g）加重蒸水至1000 mL溶解。
2. 0.2 M的 Na2HPO4：称取Na2HPO4·12H2O 71.64 g（或 Na2HPO4·7H2O 53.6 g或 Na2HPO4·2H2O 35.61 g）加重蒸水至1000 mL溶解。
3. 0.2 M pH 7.4的PB的配制：取19 mL 0.2 M的NaH2PO4和81 mL 0.2 M Na2HPO4，充分混合即为0.2 M的PB（pH约为7.4～7.5）。若pH偏高或偏低，可通过改变二者的比例来加以调整，室温保存即可。
► 25 °C下0.2 M磷酸钠缓冲液的配制
pH值 | 0.2 M Na2HPO4(mL) | 0.2 M NaH2PO4(mL) |
5.8 | 8.0 | 92.0 |
5.9 | 10.0 | 90.0 |
6.0 | 12.3 | 87.7 |
6.1 | 15.0 | 85.0 |
6.2 | 18.5 | 81.5 |
6.3 | 22.5 | 77.5 |
6.4 | 26.5 | 73.5 |
6.5 | 31.5 | 68.5 |
6.6 | 37.5 | 62.5 |
6.7 | 43.5 | 56.5 |
6.8 | 49.0 | 51.0 |
6.9 | 55.0 | 45.0 |
7.0 | 61.0 | 39.0 |
7.1 | 67.0 | 33.0 |
7.2 | 72.0 | 28.0 |
7.3 | 77.0 | 23.0 |
7.4 | 81.0 | 19.0 |
7.5 | 84.0 | 16.0 |
7.6 | 87.0 | 13.0 |
7.7 | 89.5 | 10.5 |
7.8 | 91.5 | 8.5 |
7.9 | 93.5 | 6.50 |
8.0 | 94.7 | 5.3 |
► 25 °C下0.1 M磷酸钾缓冲液的配制
pH值 | 1 M K2HPO4(mL) | 1 M KH2PO4(mL) |
5.8 | 8.5 | 91.5 |
6.0 | 13.2 | 86.8 |
6.2 | 19.2 | 80.8 |
6.4 | 27.8 | 72.2 |
6.6 | 38.1 | 61.9 |
6.8 | 49.7 | 50.3 |
7.0 | 61.5 | 38.5 |
7.2 | 71.7 | 28.3 |
7.4 | 80.2 | 19.8 |
7.6 | 86.6 | 13.4 |
7.8 | 90.8 | 9.2 |
8.0 | 94.0 | 6.0 |
1. 分子克隆（Molecular Cloning）
1) 引物Tm值计算：http://biotools.nubic.northwestern.edu/OligoCalc.html
2) 密码子优化：https://sg.idtdna.com/CodonOpt
3) 质粒图谱分析：http://wishart.biology.ualberta.ca/PlasMapper/
4) 启动子信息：https://blog.addgene.org/plasmids-101-the-promoter-region
5) addgene（一个质粒数据库）：http://www.addgene.org/vector-database/
6) NEB 内切酶buffer推荐：https://nebcloner.neb.com/#!/redigest
7) 核酸数据分析：http://biotools.nubic.northwestern.edu/OligoCalc.html
2. 蛋白表达与纯化（Protein Expression and Purification）
1) 蛋白表达菌株信息：http://wolfson.huji.ac.il/expression/bac-strains-prot-exp.html
2) 蛋白纯化：http://wolfson.huji.ac.il/purification/Purification_Protocols.html
3. 蛋白序列分析（Protein Sequence Analysis）
1) 信号肽预测：http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
2) 跨膜区预：TMpred http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html
3) 结构域预测：http://smart.embl-heidelberg.de/
4) 蛋白性质预测：http://web.expasy.org/protparam/
http://biotools.nubic.northwestern.edu/proteincalc.html
5) 蛋白质结构与功能预测：http://raptorx.uchicago.edu/
6) 二级结构预测：http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred/
7) 评估结构预测的准确性和可靠性：https://www.cameo3d.org/
8) 蛋白质结构和功能预测：https://open.predictprotein.org/
9) 三维结构比对http://ekhidna.biocenter.helsinki.fi/dali_server/start
10) 同源建模https://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/I-TASSER/
11) 同源建模：https://swissmodel.expasy.org/
12) 预测蛋白相互作用：https://string-db.org/
13) Pfam数据库是蛋白质家族的集合（根据结构域分类）：http://pfam.xfam.org/
4. 结构分析（Structure Analysis)
1) RCSB PDB 数据库：http://www.rcsb.org/
2) 晶体界面分析 PISA serverhttp://www.ebi.ac.uk/pdbe/pisa/
3) Deposition serverhttps://deposit-1.wwpdb.org/
4) 配体结构文件下载：http://www.rcsb.org/pdb/ligand/chemAdvSearch.do
5) Bernhard Rupp的生物大分子晶体学网站：http://www.ruppweb.org/Xray/101index.html
5. 其他
1) ATCC：http://www.attc.org/
2) 化学分子性质：http://www.chemicalbook.com/ProductIndex_EN.aspx
3) RNA修饰数据库：http://mods.rna.albany.edu/mods/modifications/
4) Wikipedia：https://www.wikipedia.org/
5) 各类protocols：http://openwetware.org/wiki/Protocols
6) 文献查询：https://sci-hub.tw/
6.2.2 通用测序引物
简介（INTRODUCTION）
当进行菌落PCR时，如果目的片段没有成功转化至细菌中，针对插入片段的特异性引物可能会与细菌自身DNA进行非特异性结合，产生非特异性条带，从而对我们鉴定克隆是否成功构建产生干扰。因此我们常用载体上的引物进行鉴定。利用这种引物，我们既可以检测转入的质粒是否是空载体，也能估测连入载体的插入片段大小是否正确。
以下是我们实验室常用的几个通用引物，既可以做菌落PCR，也可以用于测序。
Primer name | Site | Sequence |
Z5 | T7 promoter | TACGACTCACTATAGGGGAATTGTGAGCG |
Z6 | T7 terminator | |
Z8 | TEV and Sal I | gagaatctttatttccaaggttctgTCGAC |
Z9 | v52 Rev | GGCCAGTGAATTGTAATACGACTCACTATA |
Z10 | v55 Rev | GTTCTGATTTAATCTGTATCAGGCTGAAAA |
Z11 | pCold (v113, v114) Rev | aaatggcagggatcttagattctgtg |
XY27 | pcDNA3.1 For | taatacgactcactatagggagacccaagc |
XY28 | pcDNA3.1 Rev | tagaaggcacagtcgaggctgatca |
y936 | v108 Rev | ggctgattatgatcctctagtacttc |
Z12 | v104 For | aatttgtaatacgactcactatagggcga |
Z13 | v104 Rev | tttagaggccccaaggggttatgctagtt |
Z14 | v105 For | agatctttaatacgactcactatagggcga |
Z15 | v105 Rev | ttgagatggtgcacgatgcacagttgaa |
Z16 | V126, 127 For | agaacccactgcttactggcttatcgaaat |
Z17 | V126, 127 Rev | ctgatcagcgggtttaaactcaatggtgat |
L22 | pEGFP-N1 For | tctatataagcagagctggtttagtgaaccgtcag |
L23 | pEGFP-N1 Rev | tgcacgccgtaggtcagggtggtcac |
L28 | pCDH For | GAGCTCGTTTAGTGAACCGTCAGATCGCCT |
L29 | pCDH Rev | GTTCAATTGCCGACCCCTCCCCCCAACTTC |
第一位碱基 | 第二位碱基 | |||
U | C | A | G | |
U | UUU (Phe/F)苯丙氨酸 | UCU (Ser/S)丝氨酸 | UAU (Tyr/Y)酪氨酸 | UGU (Cys/C)半胱氨酸 |
UUC (Phe/F)苯丙氨酸 | UCC (Ser/S)丝氨酸 | UAC (Tyr/Y)酪氨酸 | UGC (Cys/C)半胱氨酸 | |
UUA (Leu/L)亮氨酸 | UCA (Ser/S)丝氨酸 | UAA (终止) | UGA (终止) | |
UUG (Leu/L)亮氨酸 | UCG (Ser/S)丝氨酸 | UAG (终止) | UGG (Trp/W)色氨酸 | |
C | CUU (Leu/L)亮氨酸 | CCU (Pro/P)脯氨酸 | CAU (His/H)组氨酸 | CGU (Arg/R)精氨酸 |
CUC (Leu/L)亮氨酸 | CCC (Pro/P)脯氨酸 | CAC (His/H)组氨酸 | CGC (Arg/R)精氨酸 | |
CUA (Leu/L)亮氨酸 | CCA (Pro/P)脯氨酸 | CAA (Gln/Q)谷氨酰胺 | CGA (Arg/R)精氨酸 | |
CUG (Leu/L)亮氨酸 | CCG (Pro/P)脯氨酸 | CAG (Gln/Q)谷氨酰胺 | CGG (Arg/R)精氨酸 | |
A | AUU (Ile/I)异亮氨酸 | ACU (Thr/T)苏氨酸 | AAU (Asn/N)天冬酰胺 | AGU (Ser/S)丝氨酸 |
AUC (Ile/I)异亮氨酸 | ACC (Thr/T)苏氨酸 | AAC (Asn/N)天冬酰胺 | AGC (Ser/S)丝氨酸 | |
AUA (Ile/I)异亮氨酸 | ACA (Thr/T)苏氨酸 | AAA (Lys/K)赖氨酸 | AGA (Arg/R)精氨酸 | |
AUG (Met/M)甲硫氨酸 | ACG (Thr/T)苏氨酸 | AAG (Lys/K)赖氨酸 | AGG (Arg/R)精氨酸 | |
G | GUU (Val/V)缬氨酸 | GCU (Ala/A)丙氨酸 | GAU (Asp/D)天冬氨酸 | GGU (Gly/G)甘氨酸 |
GUC (Val/V)缬氨酸 | GCC (Ala/A)丙氨酸 | GAC (Asp/D)天冬氨酸 | GGC (Gly/G)甘氨酸 | |
GUA (Val/V)缬氨酸 | GCA (Ala/A)丙氨酸 | GAA (Glu/E)谷氨酸 | GGA (Gly/G)甘氨酸 | |
GUG (Val/V)缬氨酸 | GCG (Ala/A)丙氨酸 | GAG (Glu/E)谷氨酸 | GGG (Gly/G)甘氨酸 | |
密码子偏好性表格：
人类密码子偏好性表格
第一位碱基 | 第二位碱基 | 第三位碱基 | |||
U | C | A | G | ||
U | UUU（17.6%） | UCU（15.2%） | UAU（12.2%） | UGU（10.6%） | U |
UUC（20.3%） | UCC (17.7%) | UAC（15.3%） | UGC (12.6%) | C | |
UUA（7.7%） | UCA（12.2%） | UAA（1%） | UGA (1.6%) | A | |
UUG（12.9%） | UCG（4.4%） | UAG (0.8%) | UGG (13.2%) | G | |
C
| CUU (13.2%) | CCU（17.5%） | CAU（10.9%） | CGU（4.5%） | U |
CUC （19.6%) | CCC（19.8%） | CAC（15.1%） | CGC（10.4%） | C | |
CUA (7.2%) | CCA（16.9%） | CAA（12.3%） | CGA（6.2%） | A | |
CUG（39.6%） | CCG（6.9%） | CAG（34.2%） | CGG（11.4%） | G | |
A | AUU（16%） | ACU (13.1%) | AAU（17%） | AGU（12.1%） | U |
AUC (20.8%) | ACC（18.9%） | AAC（19.1%） | AGC（19.5%） | C | |
AUA（7.5%) | ACA（15.1%） | AAA（24.4%） | AGA（12.2%） | A | |
AUG（22%） | ACG（6.1%） | AAG（31.9%） | AGG（12%） | G | |
G | GUU（11%） | GCU（18.4%） | GAU（21.8%） | GGU（10.8%） | U |
GUC（14.5%） | GCC（27.7%） | GAC（25.1%） | GGC（22.2%） | C | |
GUA (7.1%) | GCA（15.8%） | GAA（29%） | GGA（16.5%） | A | |
GUG (28.1%) | GCG（7.4%） | GAG（39.6%） | GGG（16.5%） | G | |
大肠杆菌密码子偏好性表格
第一位碱基 | 第二位碱基 | 第三位碱基 | |||
U | C | A | G | ||
U | UUU（24.4%） | UCU（13.1%） | UAU（21.6%） | UGU（5.9%） | U |
UUC（13.9%） | UCC (9.7%) | UAC（11.7%） | UGC (5.5%) | C | |
UUA（17.4%） | UCA（13.1%） | UAA（2%） | UGA (1.1%) | A | |
UUG（12.9%） | UCG（8.2%） | UAG (0.3%) | UGG (13.4%) | G | |
C
| CUU (14.5%) | CCU（9.5%） | CAU（12.4%） | CGU（15.9%） | U |
CUC（9.5%) | CCC（6.2%） | CAC（7.3%） | CGC（14%） | C | |
CUA (5.6%) | CCA（9.1%） | CAA（14.4%） | CGA（4.8%） | A | |
CUG（37.4%） | CCG（14.5%） | CAG（26.7%） | CGG（7.9%） | G | |
A | AUU（29.6%） | ACU (13.1%) | AAU（29.3%） | AGU（13.2%） | U |
AUC (19.4%) | ACC（18.9%） | AAC（20.3%） | AGC（14.3%） | C | |
AUA（13.3%) | ACA（15.1%） | AAA（37.2%） | AGA（7.1%） | A | |
AUG（23.7%） | ACG（13.6%） | AAG（15.3%） | AGG（4%） | G | |
G | GUU（21.6%） | GCU（18.9%） | GAU（33.7%） | GGU（23.7%） | U |
GUC（13.1%） | GCC（21.6%） | GAC（17.9%） | GGC（20.6%） | C | |
GUA (13.1%) | GCA（23%） | GAA（35.1%） | GGA（13.6%） | A | |
GUG (19.9%) | GCG（21.1%） | GAG（19.4%） | GGG（12.3%） | G | |
6.2.4 空间群表格
6.2.5 线站新衍射仪BL17U1
简介（INTRODUCTION）
上海光源BL17U1线站新衍射仪（自主研制，水平方向SOC~±0.342 μm，垂直方向SOC~±0.319 μm）和新探测器（瑞士Dectris公司的Eiger X 16 M）已经安装调试完成，11月10号开始正式对用户开放使用。但是在开放初期还需要各位老师提醒实验人员注意以下事项：
1. 由于衍射仪测角头电机比较小，如果手动上样的话很容易把位置碰歪，所以目前只能机械手上样，建议各位老师将晶体样品保存在puck里，如果没有puck，可以提前到线站借用我们线站的puck将晶体样品转移到puck里再通过机械手上样。
2. 如果在实验的过程中发生故障，一定要第一时间给值班人员打电话，不能自行去处理。
3. 建议在EIGER 16 M探测器上收数据的策略是：0.1~0.3度一张，曝光时间0.05秒一张。这样收一套360度的完整数据（3600张衍射图）大概只需要3分钟。
4. 一套3600张衍射图的数据大小是25 GB左右，建议带一个存储空间大的硬盘拷贝数据，可以边实验边拷贝数据。减少拷贝数据等待时间。
5. 数据处理建议使用XDS。
6. 目前线站的新系统还需要进一步优化调试，能量暂时固定在12.660 Kev。
Name | Backnone | Description | Cloning Frame | Fusion Tag | Sequencing Primer 1 | Sequencing Primer2 | Resistance |
|
|
V1 | pET30a | NdeI-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | none | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V2 | pET30a | NdeI-His8-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | none | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V3 | pET30a | NdeI-His8-GB1-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | His8-GB1-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V4 | pET30a | NdeI-His8-GB1-TEV-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | His8-GB1-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V5 | pET30a | NdeI-His8-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | MGSS-His8-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V6 | pET30a | NdeI-His8-TEV-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | MGSS-His8-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V7 | pET30a | NdeI-His8-SUMO-TEV-SalI,NotI-XhoI-stop | SalI-NotI | MGSS-His8-SUMO-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V8 | pET30a | NdeI-His8-VHb-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | His8-VHb-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V9 | pET30a | NdeI-His8-VHb-TEV-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | His8-VHb-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V10 | pET30a | NdeI-His8-GST-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | His8-GST-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V11 | pET30a | NdeI-His8-GST-TEV-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | His8-GST-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V12 | pET30a | NdeI-His7-TRX-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | His7-TRX-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V13 | pET30a | NdeI-His7-TRX-TEV-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | His7-TRX-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V14 | pET30a | NdeI-His8-MBP-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | His8-MBP | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V15 | pET30a | NdeI-His8-tag2-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | His8-tag2-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V16 | pET30a | NdeI-His8-tag2-TEV-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | His8-tag2-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V17 | pET30a | NdeI-DsbA-TEV-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | DsbA-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V18 | pET30a | NdeI-MBP-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | MBP | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V19 | pET30a | NdeI-His8-NusA-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | His8-NusA-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V20 | pET30a | NdeI-His8-GB1-TEV-SalI,NotI-Acidic Peptide-LacZ-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | His8-GB1-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V21 | pET30a | NdeI-His8-MBP-helical linker-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | His8-MBP-helical linker | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V22 | pMAL | NdeI-MBP-SalI,NotI-XhoI-LacZ-stop | SalI-NotI | MBP | M13R-pUC | M13F-pUC | Amp |
|
|
V23 | pMAL | NdeI-MBP-SalI,NotI-XhoI-LacZ-stop | SalI-NotI | MBP | M13R-pUC | M13F-pUC | Amp |
|
|
V24 | pMAL | NdeI-MBP-SalI,NotI-XhoI-LacZ-stop | SalI-NotI | MBP | M13R-pUC | M13F-pUC | Amp |
|
|
V25 | pMAL | NdeI-MBP-SalI,NotI-XhoI-LacZ-stop | SalI-NotI | MBP | M13R-pUC | M13F-pUC | Amp |
|
|
V26 | pMAL | NdeI-MBP-SalI,NotI-XhoI-LacZ-stop | SalI-NotI | MBP | M13R-pUC | M13F-pUC | Amp |
|
|
V27 | pMAL | NdeI-MBP-SalI,NotI-XhoI-LacZ-stop | SalI-NotI | MBP | M13R-pUC | M13F-pUC | Amp |
|
|
V28 | pET30a | NdeI-MBP-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | MBP | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V29 | pET30a | NdeI-MBP-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | MBP-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V29H | pET30a | NdeI-His8-MBP-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | His8-MBP-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V30 | pET30a | NdeI-MBP-TEV-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | MBP-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V31 | pLEXSY-Ble | NcoI-SP-SalI,NotI-His6-stop | SalI-NotI | Signal Peptide | P14 | A26 | Amp/Ble/Tet |
|
|
V32 | pLEXSY-Ble | NcoI-SP-Strep Tag-His8-TEV-SalI,NotI-His6-stop | SalI-NotI | SP-Strep Tag-His8-TEV | P14 | A26 | Amp/Ble/Tet |
|
|
V33 | pLEXSY-Ble | NcoI-SalI,NotI-His8-stop | SalI-NotI | none | P14 | A26 | Amp/Ble/Tet |
|
|
V34 | pLEXSY-Ble | NcoI-Strep Tag-SalI,NotI-His8-stop | SalI-NotI | Strep Tag | P14 | A26 | Amp/Ble/Tet |
|
|
V35 | pLEXSY-Ble | NcoI-His8-GST-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | His8-GST-TEV | P14 | A26 | Amp/Ble/Tet |
|
|
V36 | pLEXSY-Ble | NcoI-SP-Strep-His8-TEV-SalI,NotI-His6-stop | SalI-NotI | SP-Strep-His8-TEV | P14 | A26 | Amp/Ble/Tet |
|
|
V37 | pLEXSY-Ble | NcoI-Strep-His8-TEV-SalI,NotI-His6-stop | SalI-NotI | Strep-His8-TEV | P14 | A26 | Amp/Ble/Tet |
|
|
V40 | pTT5 | NcoI-His8-GB1-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | His8-GB1-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V41 | pTT5 | NcoI-His6-Strep-His8-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | His6-Strep-His8-TEV | P14 | A26 | Amp/Ble/Tet |
|
|
V42 | pTT5 | NcoI-Strep-His8-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | Strep-His8-TEV | P14 | A26 | Amp/Ble/Tet |
|
|
V51 | pFab | EcoRV-SP-Strep-His8-TEV-SalI,NotI-His6-stop | SalI-NotI | SP-Strep-His8-TEV | unknown | unknown | Amp |
|
|
V52 | pFab | EcoRV-SP-His6-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | SP-His6-TEV | unknown | unknown | Amp |
|
|
V53 | pFab | EcoRV-SP-His6-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | SP-His6-TEV | unknown | unknown | Amp |
|
|
V54 | pFab | EcoRV-SP-His6-TEV-SalI,NotI-Strep-stop | SalI-NotI | SP-His6-TEV | unknown | unknown | Amp |
|
|
V55 | pMAL | NdeI-MBP-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | MBP-TEV | M13R-pUC | M13F-pUC | Amp |
|
|
V56 | pMW103 | LexA-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | LexA | unknown | unknown | Kan | For Y2H |
|
V57 | pET30a | NdeI-hDim2-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | hDim2 | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V59 | pET30a | NdeI-His8-TEV-SalI,NotI-Lysozyme-stop | SalI-NotI | His8-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V60 | pET30a | NdeI-Lysozyme-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | Lysozyme | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V61 | pEU-01 | His6-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | His6-TEV | unknown | unknown | Amp |
|
|
V62 | pET30a | NdeI-MBP-SalI,NotI-lysozyme-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | MBP | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V63 | pET30a | NdeI-MBP-TEV-SalI,NotI-Lysozyme-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | MBP-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V64 | pET30a | NdeI-His8-MBP-TEV-SalI,NotI-Lysozyme-stop | SalI-NotI | His8-MBP-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V65 | pJG4-5 | Gal1-B42-HA epitope-EcoRI-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | Gal1-B42-HA epitope | unknown | unknown | Amp | For Y2H |
|
V66 | pET30a | NdeI-T4LS5-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | T4LS5 | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V67 | pEU-01 | NdeI-His8-NcoI-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | His8-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V71 | pET30a | NdeI-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | none | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V72 | pET30a | NdeI-SalI,NotI-Strep-stop | SalI-NotI | none | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V77 | pBAD | NdeI-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | none | pBAD for | pBAD rev | Amp |
|
|
V78 | pBAD-V28E | NdeI-MBP-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | MBP | pBAD for | pBAD rev | Amp |
|
|
V79 | pBAD-V29H | NdeI-His8-MBP-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | His8-MBP-TEV | pBAD for | pBAD rev | Amp |
|
|
V80 | pCMV-HA | HAtag-EcoRI-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | HAtag | pCMV | M13R-20 | Amp |
|
|
V81 | pBAD-V30 | NdeI-MBP-TEV-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | MBP-TEV | pBAD for | pBAD rev | Amp |
|
|
V82 | pBAD-V29HS | NdeI-His8-MBP-TEV-SalI,NotI-strep-stop | SalI-NotI | His-MBP-TEV | pBAD for | pBAD rev | Amp |
|
|
V83 | pASK-17plus | NdeI-Strep-TEV-EcoRI-BamHI-XhoI-SalI-NcoI-EcoRV-HindIII | MCS | Strep-TEV | pASk for | pASK rev | Amp |
|
|
V84 | pASK-V3 | NdeI-His8-GB1-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | His8-GB1-TEV | pASk for | pASK rev | Amp |
|
|
V85 | pASK-V28E | NdeI-MBP-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | MBP | pASk for | pASK rev | Amp |
|
|
V86 | pASK-V29H | NdeI-His8-MBP-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | His-MBP-TEV | pASk for | pASK rev | Amp |
|
|
V87 | pASK-V30 | NdeI-MBP-TEV-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | MBP-TEV | pASk for | pASK rev | Amp |
|
|
V88 | pASK-V29HS | NdeI-His8-MBP-TEV-SalI,NotI-Strep-stop | SalI-NotI | His-MBP-TEV | pASk for | pASK rev | Amp |
|
|
V89 | pET30a | NdeI-InfB21-eGFP-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | InfB21-eGFP | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V90 | pET30a | NdeI-InfB21-eGFP-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | InfB21-eGFP | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V91 | pET30a | NdeI-His8-eGFP-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | His8-eGFP-TEV | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V92 | pET30a | NdeI-SUMO-SalI,NotI-Strep-stop | SalI-NotI | SUMO | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V93 | pET30a | NdeI-His8-MBP-TEV-GFP-SalI,NotI-Strep-stop | SalI-NotI | His8-MBP-TEV-GFP | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V94 | pET30a | NdeI-VHb-SalI,NotI-Strep-stop | SalI-NotI | VHb | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V95 | pET30a | NdeI-Tag2-SalI,NotI-Strep-stop | SalI-NotI | Tag2 | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V96 | pET30a | NdeI-MBP-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | MBP | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V97 | pET30a | NdeI-MBP-SalI,NotI-Strep-stop | SalI-NotI | MBP | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V98 | pFab | EcoRV-SP-NdeI-His8-SalI,NotI-Strep-stop | SalI-NotI | SP-His8 | unknown | unknown | Amp |
|
|
V99 | pET30a | NdeI-MBP-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | MBP | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V100 | pET30a | NdeI-MBP-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | MBP | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V101 | pET30a | NdeI-GlyA-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | GlyA | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V102 | pET30a | NdeI-GacH-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | GacH | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V103 | pET30a | NdeI-XBP1-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | XBP1 | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V104 | pGBKT7SN | DNA Binding-XhoI-NdeI-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | DNA Binding | T7 Promoter | ADH | Kan |
|
|
V105 | pGADT7SN | SV40-AD-NcoI-Epitope-NdeI-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | SV40-AD-Epitope | T7 Promoter | ADH | Amp |
|
|
V106 | pRmHa3 | EcoRI-TEV-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | TEV | pRmHa3 for | pRmHa3 rev | Amp |
|
|
V107 | pVL1392 | NcoI-NotI-HIs6-stop | unknown | none | y326 polyhedrin | y327 polyhedrin | Amp |
|
|
V108 | plSUMOstar | HIs6-SUMOstar-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | SUMOstar | unknown | unknown | Amp/Get |
|
|
V109 | pFastBacHT | NdeI-InfB21-His8-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | InfB21-His8-TEV | pASk for | pASK rev | Amp/Get |
|
|
V110 | pFastBacHT | NdeI-SalI,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | none | pASk for | pASK rev | Amp/Get |
|
|
V111 | pFastBacHT | NdeI-His8-MBP-TEV-Sali,NotI-stop | SalI-NotI | His8-MBP-TEV | pASk for | pASK rev | Amp/Get |
|
|
V112 | pFastBacHT | NdeI-His8-MBP-TEV-Sali,NotI-XhoI-His6-stop | SalI-NotI | His8-MBP-TEV | pASk for | pASK rev | Amp/Get |
|
|
V113 | pColdII | NdeI-His8-MBP-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | His8-MBP-TEV | pCold for | pCold rev | Amp |
|
|
V114 | pColdII | NdeI-MBP-TEV-SalI,NotI-stop | SalI-NotI | MBP-TEV | pCold for | pCold rev | Amp |
|
|
V115 | pColdII | NdeI-XhoI-His6-stop | unknown | none | pCold for | pCold rev | Amp |
|
|
V116 | pET30a | NdeI-B562-XhoI-His6-stop | unknown | B562 | T7 Promoter | T7 Terminator | Kan |
|
|
V117 | pCold |
|
|
|
|
|
|
|
|
V118 | pGADzaA |
|
|
|
|
|
|
|
|
V119 | FBQH | His8-TEV-BamHI-XhoI | BamHI-XhoI | His8-TEV | FBQ-F | FBQ-R | Amp |
|
|
V120 | FBQH | GST-TEV-BamHI-Xho I | BamHI-XhoI | GST-TEV | FBQ-F | FBQ-R | Amp |
|
|
V121 | FBQH | His-MBP-TEV-BamHI-XhoI | BamHI-XhoI | His-MBP-TEV | FBQ-F | FBQ-R | Amp |
|
|
V122 | PET30a | NdeI- His8- GB1 -Sal I -Not I-stop | Sal I-Not I | His8- GB1 | T7-P | T7-T | Kan | XY |
|
V123 | pCDNA3.1 | CMV-T7-FLAG-MCS-Stop | XhoI-BamH I-EcoR I-Not I | FLAG | T7/CMV | BGH-R | Amp | XY |
|
V124 | pCDNA3.1 | CMV-T7-HA-MCS-Stop | XhoI-BamH I-EcoR I-Not I | HA | T7/CMV | BGH-R | Amp | XY |
|
V125 | pCDNA3.1 | CMV-T7-Strep-MCS-Stop | XhoI-BamH I-EcoR I-Not I | Strep | T7/CMV | BGH-R | Amp | XY |
|
V126 | pCDNA3.1 | CMV-T7-SP-3XFLAG-MCS-Stop | XhoI-BamH I-EcoR I-Not I | 3XFLAG | T7/CMV | BGH-R | Amp | XY | SP=signal peptide |
V127 | pCDNA3.1 | CMV-T7-SP-FLAG-Clover-MCS-Stop | XhoI-BamH I-EcoR I-Not I | Clover/FLAG | T7/CMV | BGH-R | Amp | XY | SP=signal peptide |
V128 | pCDNA3.1 | CMV-T7-SP-HA-MCS-Stop | XhoI-BamH I-EcoR I-Not I | HA | T7/CMV | BGH-R | Amp | XY | SP=signal peptide |
V129 | pCDNA3.1 | CMV-T7-SP-Strep-mRubby2-MCS-Stop | XhoI-BamH I-EcoR I-Not I | Strep/mRubby2 | T7/CMV | BGH-R | Amp | XY | SP=signal peptide |
V130 | pCDNA3.1 | CMV-T7-SP-MCS-Stop | XhoI-BamH I-EcoR I-Not I | Strep | T7/CMV | BGH-R | Amp | XY |
|
V131 | pCDNA3.1 | CMV-T7-Strep-mRubby2-MCS-Stop | XhoI-BamH I-EcoR I-Not I | Strep/mRubby2 | T7/CMV |